Sample information |
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| Picture |
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| Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Collection date | 02/02/2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Captive / Cultivated? | Captive / Cultivated | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Group | Hawaii Community College | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Observations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Putative identification | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Methods |
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| Extraction kit | Edwards Buffer | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNA extraction location | Whole arthropod | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Single or Duplex PCR | Single Reaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gel electrophoresis system | Edvotek Gel Electrophoresis | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Buffer | TBE | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNA stain | SYBR Safe | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gel images |
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| Protocol notes | 200 voltage, 2% agarose, below is gel electrophoresis map
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Results |
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| Wolbachia presence | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Confidence level | Medium | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Explanation of confidence level | The positive and negative controls worked showing the data is accurate. |
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| Wolbachia 16S sequence | |
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| Arthropod COI sequence | Download FASTA
Download AB1
GTATTCTAATCCGAGCTGAACTGGGTCATCCTGGTGCTTTAATTGGAGACGACCAAATTTATAATGTAATCGTCACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATAGTGATACCTATTATAATCGGTGGGTTTGGAAATTGATTAGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCTGATATAGCTTTCCCACGAATAAATAATATAAGATTTTGACTTCTTCCCCCTGCTTTATCACTTTTATTAGTAAGAAGTATAGTTGAAAACGGAGCTGGGACAGGGTGAACTGTTTACCCACCTCTATCATCAGGAATCGCCCATGGAGGAGCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCCGGAATCTCTTCAATTTTAGGGGCAGTTAATTTTATTACAACTGTAATTAATATACGATCAACAGGAATTACTCTTGATCGTATACCTTTATTTGTTTGGTCAGTCGTAATTACTGCACTTTTATTATTATTATCTCTTCNAGTTTTAGCCGGGGCTATTACTATGTTACTAACTGATCGAAATTTAAACACATCATTTTTTGACCCTGCAGGAGGAGG
BLAST at The Wolbachia Project BLAST at NCBI
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| Summary | The Arthropoda was found to be negative for Wolbachia. | ||||||||||||||||||||||||||||||||


Common Eastern Bumble Bee (Bombus impatiens)
American Bird
Spotted crane fly
Wolbachia data
Meadow Katydid