Cecidomyiidae sp._Flagge_02

October 24, 2024

Sample information
Picture
Photos by: Nishant S.
Location
Collection date 08/28/2024
Captive / Cultivated? Wild-caught
Group Kantonsschule Zuercher Unterland
Observations

Die Probe wurde auf einer wand im einem Keller einer Wohnung gefunden. Der Keller war ziemlich trocken.
Putative identification Arthropoda Hexapoda Insecta Diptera Cecidomyiidae

Methods
Extraction kit Instagene Matrix
DNA extraction location body without wings
Single or Duplex PCR Single Reaction
Gel electrophoresis system MiniOne
Buffer TBE
DNA stain Midori 1:20'000
Gel images
Protocol notes
  1. Vortex und Zentrifuge verwechselt
  2. Zu kurz gevortext
  3. Falsch zentrifugiert
  4. Diese Probe (hier also 02) ist #2

Results
Wolbachia presence No
Confidence level Medium
Explanation of confidence level

Wenn ein Band für die Arthropoden-DNA auf dem Gel sichtbar ist, kann man davon ausgehen, dass die PCR-Reaktion erfolgreich war und die Polymerase ordnungsgemäß funktioniert hat. Das Vorhandensein eines Bands bestätigt, dass die Zielsequenz amplifiziert wurde. Falls jedoch kein Band zu sehen wäre, könnte dies darauf hindeuten, dass entweder die Probe negativ war oder dass die Polymerase nicht richtig gearbeitet hat
Wolbachia 16S sequence
Arthropod COI sequence Download FASTA    Download AB1
Konsensus
BLAST at The Wolbachia Project   BLAST at NCBI
Summary The Cecidomyiidae was found to be negative for Wolbachia.
Report Inappropriate Post